КОНТРОЛЬНІ ЗАПИТАННЯ. 1. Напишіть стандартні скорочення для 20 амінокислот

1. Напишіть стандартні скорочення для 20 амінокислот. На які дві групи їх можна поділити за фізико-хімічними властивостями?

2. Які властивості має пептидна група? Чи взаємодіє вона з водою?

3. Що таке вторинна структура білка? Укажіть типи й основні риси вторинних структур, що зустрічаються у глобулярних білках. Які взаємодії стабілізують регулярну вторинну структуру?

4. Які взаємодії є основною рушійною силою, що зумовлює укладання поліпептидного ланцюга в компактну глобулу?

5. Укажіть основні загальні риси структури глобулярних водорозчинних білків. Чому глобула завжди формується елементами регулярної вторинної структури?

6. Які взаємодії зумовлюють твердість білкової глобули? Яке значення має твердість білка для його функціонування?

7. Що таке структурний мотив? Укажіть основні структурні мотиви, що часто зустрічаються у глобулярних білках.

8. Як структура мембранних білків відрізняється від такої водорозчинних?

9. За рахунок чого є можливим перемикання структури білка між двома конформаційними станами?

10. У чому полягає фізична природа ферментативного каталізу?

11. За яким принципом використовується вільна енергія гідролізу АТР для здійснення реакцій синтезу?

12. Як використовується вільна енергія гідролізу АТР для виконання роботи молекулярними машинами? Сформулюйте основні принципи роботи молекулярних машин.

РЕКОМЕНДОВАНА ЛІТЕРАТУРА

1. Ленинджер, А. Основы биохимии: в 3 т. − М.: Мир, 1985.

2. Фершт, Э. Структура и механизм действия ферментов. − М.: Мир, 1980.

3. Финкельштейн, А.В. Птицын, О.Б. Физика белка. Курс лекций. − М.: КДУ, 2005.

4. Чернавский, Д.С. Чернавская, Н.М.. Белок − машина. Биологические макромолекулярные конструкции. − М.: МГУ, 1999.

5. Шульц, Г., Ширмер, Р. Принципы структурной организации белков. − М.: Мир., 1982.

6. Branden, C.I., Tooze, J. Introduction to protein structure.– New York :Garland Science, 1999.

7. Creighton, T. Proteins: structure and molecular properties. – New York: W.H.Freeman and Company.1992.

8. Lesk, A.M. Introduction to protein architecture: the structural biologyof proteins. – Oxford : Oxford University Press, 2001.

9. Spirin, A.A. Ribosome as a molecular machine // FEBS Letters.– 2002. – Vol. 514. – P. 2–10.