КОНТРОЛЬНІ ЗАПИТАННЯ. 1. Як за своїм складом і спорідненістю до ДНК розрізняються кор- і голофермент бактеріальної РНК-полімерази?

1. Як за своїм складом і спорідненістю до ДНК розрізняються кор- і голофермент бактеріальної РНК-полімерази? Яке значення має ця різниця для ініціації транскрипції?

2. Яку будову має стандартний бактеріальний промотор?

3. Чим розрізняються закритий і відкритий комплекси РНК-полімерази з промотором?

4. У якому напрямку здійснюється зчитування інформації з ДНК під час транскрипції? Що таке змістовний і антизмістовний ланцюги? Який з них є матричним?

5. Яку роль відіграє σ-фактор в ініціації транскрипції?

6. Як забезпечується висока процесивність РНК-полімерази?

7. Як організовано активний центр РНК-полімерази? Які сполуки є субстратами (будівним матеріалом) синтезу РНК?

8. Опишіть основні етапи елонгаційного циклу РНК-полімерази. Чому фермент рухається вздовж ДНК під час транскрипції?

9. Яким чином здійснюється при транскрипції редагування помилок приєднання нуклеотидів?

10. Як здійснюється термінація транскрипції у бактерій?

11. Яка різниця між цис- і транс-елементами системи регуляції транскрипції?

12. Опишіть систему регуляції лактозного оперона. Яку роль у регуляції відіграють lac-репресор і білок САР?

13. Що таке антитермінація?

14. Як здійснюється атенюація в триптофановому опероні?

15. За якими механізмами здійснюється регуляція загального рівня транскрипції в бактеріальній клітині?

16. Охарактеризуйте стадії життєвого циклу бактеріофага λ. Як відбувається перемикання між різними шляхами розвитку?

17. Репресор бактеріофага λ є позитивним чи негативним регулятором транскрипції гена cro? Гена сІ?

РЕКОМЕНДОВАНА ЛІТЕРАТУРА

1. Пташне, М. Переключение генов. Регуляция генной активности и фаг λ. – М.: Мир, 1988.

2. Busby, S., Ebright, R.H. Promoter structure, promoter recognition, andtranscription activation in prokaryotes // Cell. – 1994. – Vol. 79. – Р. 743 – 746.

3. Ciampi, M.S. Rhodependent terminators and transcription termination// Microbiology. – 2007. – Vol. 152. – Р. 2515 – 2528.

4. Greive, S.J., von Hippel, P.H. Thinking quantitatively about transcriptionalregulation // Nature Rev. – 2005. – Vol. 6. – Р. 221 – 232.

5. Lane, W.J., Darst, S.A. The structural basis for promoter – 35 element recognition by the group IV σ-factors // PLoS Biol. – 2006. – Vol. 4 (9). – Р. 269.

6. Steitz, T.A. Visualizing polynucleotide polymerase machines at work// EMBO J. – 2006. – Vol. 25. – Р. 3458 – 3468.

7. Wassarman, K.M., Saecker, R.M. Synthesis mediated release of a small RNA inhibitor of RNA polymerase // Science. – 2006. – Vol. 314. – Р. 1601 – 1603.

8. Willenbrock, H., Ussery, D.W. Chromatin architecture and geneexpression in Escherichia coli. //Genome Biology. – 2004. – Vol. – 5. – Р. 252.

9. Wilson, C.J., Zhan, H., SwintKruse, L., Matthews, K.S. The lactoserepressor system: paradigms for regulation, allosteric behavior andprotein folding // Cell Mol. Life Sci. – 2007. – Vol. 64. – Р. 3 – 16.

10. Young, B.A., Gruber, T.M., Gross, C.A. Views of transcription initiation // Cell. – 2002. – Vol. 109. – Р. 417 – 420.