Поглощение света

В видимой области поглощают только хромопротеины (гемоглобин, миоглобин, каталаза и др.).

В УФ области все белки (кроме протаминов) имеют широкую полосу поглощения (275 – 278 нм). Свет здесь поглощается сопряженными ядрами триптофана, фенилаланина и тирозина. Коэффициент молярной экстинкции вблизи этих длин волн зависит от количества в белке хромофорных групп, содержащих сопряжённые π-электроны. Эта полоса (~ 280 нм) объясняется возбуждением π-электронов. От белка к белку эта полоса может деформироваться и смещаться т.к. зависит от аминокислотного состава. На спектр поглощения влияют различные типы комплексообразования, ионные и дипольные взаимодействия, водородные связи групп, присоединенных к хромофору, pH среды и т.д. Поглощает также пептидная связь при длине волны ~ 190 нм. Но измерениям при этой длине волны мешает поглощение боковых радикалов, поэтому спектр надо поправлять с учетом поглощения боковых групп.

Экстинкция статических клубков экспериментально оказывается выше, чем спирали (для полиглутаминовой кислоты на 42%). Уменьшение оптической плотности при переходе конформации белка от клубка к спирали, называется гипохромным эффектом. Интенсивность поглощения зависит от дипольного момента перехода. Когда белок не имеет регулярной (спиральной) структуры, дипольные моменты перехода, ориентация которых связана с ориентацией пептидных групп, никак не коррелированны, поэтому их взаимодействие компенсируется. Когда возникает спираль – пептидные группы (и дипольные моменты) ориентированы примерно параллельно. При такой пространственной ориентации между ними возникают электростатические силы, которые и приводят к ослаблению поглощения света.