Ñòðîåíèå ôåðìåíòîâ. Ôåðìåíòû, ÿâëÿÿñü áåëêàìè, ïîâòîðÿþò âñå îñîáåííîñòè ñòðóêòóðû è ñîñòàâà áåëêîâ (ñîñòîÿò èç àìèíîêèñëîò
Ôåðìåíòû, ÿâëÿÿñü áåëêàìè, ïîâòîðÿþò âñå îñîáåííîñòè ñòðóêòóðû è ñîñòàâà áåëêîâ (ñîñòîÿò èç àìèíîêèñëîò, èìåþò 4 óðîâíÿ ñòðóêòóðíîé îðãàíèçàöèè), ôèçèêî-õèìè÷åñêèå ñâîéñòâà áåëêîâ. Ôåðìåíòû, êàê è âñå ôóíêöèîíàëüíûå áåëêè, ìîãóò áûòü ïðîñòûìè è ñëîæíûìè.
Ïðîñòûå ôåðìåíòû ïðåäñòàâëåíû òîëüêî áåëêîâîé ÷àñòüþ (ñîñòîÿò èç àìèíîêèñëîò) - ïåïñèí, òðèïñèí, ôîñôàòàçû.
Ñëîæíûå ôåðìåíòû ïðåäñòàâëåíû:
1 .Áåëêîâîé ÷àñòüþ (ñîñòîèò èç àìèíîêèñëîò) - àïîôåðìåíò;
2.Íåáåëêîâîé ÷àñòüþ.
Íåáåëêîâàÿ ÷àñòü ìîæåò áûòü ïðåäñòàâëåíà:
· èîíàìè ìåòàëëîâ (Ê, Na, Ca, Mg, Mn);
· êîôåðìåíòàìè - íèçêîìîëåêóëÿðíûå îðãàíè÷åñêèå âåùåñòâà.
Äëÿ ìíîãèõ ôåðìåíòîâ åãî àïîôåðìåíò âìåñòå ñ íåáåëêîâîé ÷àñòüþ îáðàçóþò êàòàëèòè÷åñêè àêòèâíóþ ìîëåêóëó, êîòîðàÿ íàçûâàåòñÿ õîëîôåðìåíòîì.
 ðîëè áèîêàòàëèçàòîðîâ ìîãóò âûñòóïàòü è íåáåëêîâûå ñîåäèíåíèÿ. Ðèáîçèìû - áèîêàòàëèçàòîðû, êîòîðûå ïî õèìè÷åñêîé ïðèðîäå ÿâëÿþòñÿ ÐÍÊ.
Ðèáîçèìû êàòàëèçèðóþò ðàçðûâ ôîñôîäèýôèðíûõ ñâÿçåé íóêëåèíîâûõ êèñëîò.
 ïðîñòðàíñòâåííîé ñòðóêòóðå ôåðìåíòà ìîæíî âûäåëèòü îòäåëüíûå ó÷àñòêè, êîòîðûå âûïîëíÿþò òå èëè èíûå ôóíêöèè (àêòèâíûé öåíòð, êîíòàêòíûé ó÷àñòîê, êàòàëèòè÷åñêèé ó÷àñòîê, àëëîñòåðè÷åñêèé öåíòð).
Àêòèâíûé öåíòð - ýòî ó÷àñòîê â ìîëåêóëå ôåðìåíòà, ãäå ïðîèñõîäèò ñâÿçûâàíèå è ïðåâðàùåíèå ñóáñòðàòà. Àêòèâíûé öåíòð îáû÷íî ðàñïîëàãàåòñÿ â ãèäðîôîáíîì óãëóáëåíèè (íåäîñòóïíîì äëÿ ìîëåêóë âîäû), èçîëèðóÿ ñóáñòðàò îò âîäû.  îáðàçîâàíèè àêòèâíîãî öåíòðà, ó÷àñòâóþò áîêîâûå ãðóïïû ÀÊ (12-20 ÀÊ), ïðè÷¸ì ýòè ÀÊ ìîãóò íàõîäèòüñÿ íà ðàçíûõ ó÷àñòêàõ ïîëèïåïòèäíîé öåïè, íî ïðè ôîðìèðîâàíèè ïðîñòðàíñòâåííîé êîíôèãóðàöèè ôåðìåíòà îíè óêëàäûâàþòñÿ ò.î., ÷òî ðàñïîëàãàþòñÿ â îáëàñòè àêòèâíîãî öåíòðà.  îáðàçîâàíèè àêòèâíîãî öåíòðà ïðèíèìàþò ó÷àñòèå ñëåäóþùèå ãðóïïû áîêîâûõ öåïåé ÀÊ:
– NH2 (àðã, ëèç);
– ÑÎÎÍ (àñï, ãëó);
– SH (öèñ);
– ÎÍ (ñåð, òðå);
– èìèäàçîëüíîå êîëüöî (ãèñ);
– ãóàíèäèíîâàÿ ãðóïïà (àðã);
– ôåíîëüíîå êîëüöî (òèð).
Îñòàëüíûå ÀÊ ïîääåðæèâàþò ïðîñòðàíñòâåííóþ êîíôèãóðàöèþ àêòèâíîãî öåíòðà ôåðìåíòà
è îáåñïå÷èâàþò åãî ðåàêöèîííóþ ñïîñîáíîñòü.
Êîíòàêòíûé (ñóáñòðàò-ñâÿçûâàþùèé ) ó÷àñòîê - ýòî ìåñòî â àêòèâíîì öåíòðå ôåðìåíòà, ãäå ïðîèñõîäèò ñâÿçûâàíèå ñóáñòðàòà ñ åãî àêòèâíûì öåíòðîì. Êîíòàêòíûé ó÷àñòîê îáåñïå÷èâàåò ñïåöèôè÷åñêîå ñðîäñòâî ñóáñòðàòà ê ôåðìåíòó.
Êàòàëèòè÷åñêèé ó÷àñòîê - ìåñòî, ãäå ïðîõîäèò ñàìà êàòàëèòè÷åñêàÿ ðåàêöèÿ.
Àëëîñòåðè÷åñêèé öåíòð - ó÷àñòîê â ìîëåêóëå ôåðìåíòà, ïðîñòðàíñòâåííî óäàëåííûé îò àêòèâíîãî öåíòðà. Ê àëëîñòåðè÷åñêîìó öåíòðó ìîãóò ïðèñîåäèíÿòüñÿ ðàçëè÷íûå âåùåñòâà, êîòîðûå îòëè÷àþòñÿ ïî ñòðóêòóðå îò ìîëåêóë ñóáñòðàòà. Ýòè âåùåñòâà íàçûâàþòñÿ àëëîñòåðè÷åñêèå ýôôåêòîðû. Îíè ìîãóò âëèÿòü íà êîíôîðìàöèþ àêòèâíîãî öåíòðà ôåðìåíòà, èçìåíÿÿ å¸, ò.å. ìîãóò èëè ïîâûøàòü ñêîðîñòü ðåàêöèè, èëè òîðìîçèòü å¸.
ðèñ. Àêòèâíûé öåíòð ôåðìåíòà
˜
Ïðåäûäóùèé ðàçäåë | Ðàçäåë âåðõíåãî óðîâíÿ | Ñëåäóþùèé ðàçäåë |
Äàòà äîáàâëåíèÿ: 2015-07-06; ïðîñìîòðîâ: 1383;