КОНТРОЛЬНІ ЗАПИТАННЯ. 1. Як саме починається гомологічна рекомбінація?

1. Як саме починається гомологічна рекомбінація? Як здійснюється точна репарація дволанцюгових розривів за рекомбінаційним механізмом?

2. Що таке гетеродуплекс? Яку роль відіграє білок recA при гомологічній рекомбінації?

3. Дайте визначення структури Холідея. В якій формі вона реалізується під час гомологічної рекомбінації? За рахунок чого стабілізується така форма?

4. За яким механізмом відбувається міграція гілки під час гомологічної рекомбінації?

5. Як здійснюється поділ структури Холідея під час гомологічної рекомбінації? З якою імовірністю відбувається обмін ділянками між двома гомологічними молекулами ДНК і від чого залежить реалізація такого обміну?

6. Що відбувається з гетеродуплексом після завершення гомологічної рекомбінації?

7. Чим відрізняється сайтс-пецифічна рекомбінація від гомологічної?

8. Що таке незаконна рекомбінація?

9. Як побудовані кластери імуноглобулінових генів? Які події при дозріванні імуноглобулінового гена можна віднести до сайт-специфічної рекомбінації?

10. Якими механізмами забезпечується необмежене зростання розмаїття послідовностей імуноглобулінових генів при їхньому дозріванні?

11. Яка різниця між реплікативним і нереплікативним механізмами переміщення ДНК-транспозонів?

12. Яка різниця між механізмами переміщення LTR-ретропозонів і мобільних елементів типу LINE?

13. Чим різняться мобільні елементи типів LINE і SINE?

РЕКОМЕНДОВАНА ЛІТЕРАТУРА

1. Boeke, J.D., Chapman, K.B. Retrotransposition mechanisms // Curr.Opin. Cell Biol. – 1991. – Vol. 3. – P. 502 – 507.

2. Grindley, N.G.F., Leschziner, A.E. DNA transposition: from a black boxto a color monitor // Cell. – 1995. – Vol. 83. – P. 1063 – 1066.

3. Haniford, D.B., Chaconas G. Mechanistic aspects of DNA transposition// Curr. Opin. Genet. Dev. – 1992. – Vol. 2. – P. 698 – 704.

4. International Human Genome Sequencing Consortium. Initial sequencingand analysis of the human genome // Nature. – 2001. – Vol. 409. –– P. 860 – 921.

5. Kazazian, H.H., Moran, J.V. The impact of L1 retrotransposons on thehuman genome // Nature Gen. – 1998. – Vol. 19. – P. 19 – 24.

6. Kuzimov, A. Unraveling the late stages of recombinational repair: metabolismof DNA junctions in E. coli // BioEssays. – 1996. – Vol. 18.– P. 757 – 765.

7. Labhart, P. Nonhomologous DNA end joining in cellfree systems// Eur. J. Biochem. – 1999. – Vol. 265. – P. – 849 – 861.

8. Landy, A. Dynamic, structural, and regulatory aspects of lambda sitespecificrecombinations // Annu. Rev. Biochem. – 1989. – Vol. 58. – P. 913 – 949.

9. Levin, K.L. It’s prime time for reverse transcriptase // Cell. – 1997. – Vol. 88. – P. 5 –8.

10. Sadofsky, M.J. The RAG proteins in V(D)J recombination: more thanjust a nuclease // Nucl. Acids Res. – 2001. – Vol. 29. – P. 1399 – 1409.

11. Singer, M. F. LINE1: a human transposable element // Gene. – 1993. – Vol. 135. – P. 183 – 188.

12. Stahl, F. Meiotic recombination in yeast: coronation of the doublestrandbreak repair model //Cell. – 1996. – Vol. 87. – P. 965 – 968.

13. West, S.F. Enzymes and molecular mechanisms of genetic recombinations// Annu. Rev. Biochem. – 1992. – Vol. 61. – P. 603 – 640.

14. West S. Processing of recombination intermediates by the Ruv ABCproteins // Annu. Rev. Genet. – 1997. – Vol. 31. – P. 213 – 244.