Со временем состав Думы численно возрастал (при Годунове в ней было 30 человек, а в конце XVII века 167 человек). В ее состав были введены думные дворяне и дьяки.

В разные годы значение Боярской Думы то усиливалось, то снижалось. После смерти Бориса Годунова (1606 г.) роль Думы временно возросла. В 1610 году в результате борьбы между различными группировками боярства последовало свержение с престола царя Василия Шуйского. Вся полнота власти временно перешла к Боярской Думе, т.е. государством фактически стали управлять 7 влиятельных бояр («семибоярщина»).

В компетенцию Боярской Думы входили наиболее важные вопросы внутренней и внешней политики, контроль административного и судебного аппарата. Дума занимала промежуточное положение между монархом и всей системой административных учреждений – приказов и органов местного управления. Поэтому в ней решались дела особой трудности, которые по каким-то причинам не могли быть решены в приказах. По существу Боярская Дума была совещательным органом при государе. Современные исследователи определяют Думу как высший консультативный орган московской политической системы. Члены Думы составляли правящую элиту.

При Боярской Думе были созданы специальное делопроизводство, канцелярия с дьяками и подьячими. Можно сказать, что при Думе начал создаваться своего рода чиновничье-бюрократический аппарат, который имел постоянные контакты с приказами и давал возможность более реально решать вопросы управления.

Земские Соборы–это был принципиально новый высший орган государства. Через них царь привлек к управлению государством определенные круги дворянства и посадского населения. Земские Соборы собирались в наиболее важные для страны моменты. Первый Собор был созван в 1549 году («Собор примирения»), а последний – в 1653 году. Таким образом, этот орган просуществовал более 100 лет. Земский Собор не представлял собою единого собрания представителей. Каждое сословие заседало отдельно. И система выборов, и структура, и деятельность Соборов была пронизана сословным началом.

В своего рода «верхней палате» Собора вместе с царем заседали Освещенный Собор (высшее духовенство) и Боярская Дума. Они входили в Собор не по избранию, а по положению. «Нижнюю палату» составляли представители дворянства и посадских людей.

Выборы представителей от дворянства и посадских людей производились отдельно, что и характеризует сословный характер Земских Соборов. На места рассылались грамоты, в которых предлагалось прислать по одному или по два человека от дворян и от посадских людей. Интересно, что каждое сословие заседало и подавало свои мнения отдельно.

Земские Соборы рассматривали важнейшие государственные вопросы: