III) По полярности бокового радикала

1) a–аминокислоты с неполярным (гидрофобным) радикалом: Ala, Leu, Val и т.д.

2) a–аминокислоты с полярным радикалом (гидрофильным), содержащим полярные группировки (ОН–, SH–, COOH–, NH₂–):

а) ионогенные – способные к ионизации в условиях организма, например, фенольный гидроксил тирозина.

б) неионогенные – неспособные переходить в ионное состояние в организме, например, спиртовый гидроксил серина.

В белках ионогенные группы располагаются на поверхности и обуславливают электростатическое взаимодействие. Неионогенные располагаются как на поверхности белка, так и внутри и образуют водородные связи. Таким образом, и те и другие участвуют в формировании пространственной структуры белка.

Стереоизомерия a–аминокислот.

Все a–аминокислоты, кроме глицина, имеют центр хиральности и потому оптически активны.

СООН СООН Принадлежность к D– и L– ряду

определяют по глицериновому

Н – С* – NH₂ NH₂ – С* – Н альдегиду.

R R

D–a–аминокислота L–a–аминокислота

Энантиомеры

Почти все природные a–аминокислоты относятся к L–ряду, а в построении белков организма участвуют только L–a–аминокислоты. С этим связана стереоспецифичность ферментов: они состоят из L–a–аминокислот и расщепляют белки, состоящие только из L–a–аминокислот. Расщепление же белков из D–a–аминокислот ферментативно невозможно. По этой причине ферменты животных и человека абсолютно бессильны перед вирусом «сибирской язвы», так как в состав белка вируса входит D–глутаминовая кислота.