Строение пептидной связи

В амидах связь углерод-азот является частично двоесвязанной вследствие р,p-сопряжения НПЭ атома азота и p-связи карбонила (длина связи С-N: в амидах - 0,132 нм , в аминах - 0,147 нм), поэтому амидная группа является плоской и имеет транс-конфигурацию. Таким образом, пептидная цепь представляет собой чередование плоских фрагментов амидной группы и фрагментов углеводородных радикалов соответствующих аминокислот. В последних вращение вокруг простых связей незатруднено, следствием этого является образование различных конформеров. Длинные цепи пептидов образуют a-спирали и β-структуры (аналогично белкам).