Мутагены (как и вызываемые ими мутации) подразделяют по происхождению (источнику) на эндогенные и экзогенные, а по природе на физические, химические и биологические.

Экзогенные мутагены. Их большинство; к ним относятся различные и многочисленные факторы внешней среды (например, радиационное излучение, алкилирующие агенты, окислители, многие вирусы).

Эндогенные мутагены.Они образуются в процессе жизнедеятельности организма (например, мутации могут возникать под влиянием свободных радикалов и продуктов липопероксидации).

Физические мутагены. Ими являются ионизирующее излучение (например, рентгеновское, α‑, β‑, γ‑лучи, нейтроны, излучение радиоактивного радия, радона, изотопов калия, углерода, УФ–излучение и т.д. ). К мутациям может привести воздействие чрезмерно высокой или низкой температуры.

Химические мутагены. Это самая многочисленная группа мутагенов. К ним относятся: –сильные окислители или восстановители (например, нитраты, нитриты, активные формы кислорода); –алкилирующие агенты (например, йодацетамид); –пестициды (например, гербициды, фунгициды); –некоторые пищевые добавки (например, ароматические углеводороды, цикламаты); –продукты переработки нефти; –органические растворители; –ЛС (например, цитостатики, содержащие ртуть средства, иммунодепрессанты).

Биологические мутагены.Примерами их могут быть вирусы

(например, кори, краснухи, гриппа), продукты метаболизма или антигены некоторых микроорганизмов.