Отдел Актинобактерии - Actinobacteria.

Молекулярные маркеры: все виды характеризует высокое содержание ГЦ-пар в геноме.

Окраска по Граму: грамположительные.

Морфология клетки: в отдел собраны самые разнообразные формы бактерий. Среди других эубактерий выделяются сложной морфологической организацией клеток. Филогенетически близкие роды характеризуются разнообразием по морфологии, физиологии и химическим маркерам. Форма клетки – от кокковидной до мицелиальной, включая палочки, палочки неправильной формы (раздутые ‒ эллиптические, грушевидные, булавовидные, изогнутые, одиночные, парные, V-образные, в цепочках), палочки сильно вариабельные по форме, ветвящиеся палочки. У многих форм мицелий имеет тенденцию к фрагментации. У наиболее сложно организованных форм имеется развитый субстратный и воздушный мицелий и спорангии со спорами. Палочки неподвижные, иногда подвижные. Мицелий над субстратом формирует отдельные клетки типа конидии – одиночные (аналогичны эндоспорам) и в цепочках, либо спорангиоспоры.

Основные морфологические группы актиномицетов: (1) Cпороактиномицеты (наиболее характерный род – Streptomyces) – образуют споры в цепочках (артроспоры) или клубочках (алейроспоры) на воздушном мицелии; субстратный мицелий не распадается. (2) Нокардиоформные (нокардиомормы) актиномицеты (Nocardia, Rhodococcus) – субстратный мицелий распадается на палочки; воздушный мицелий обычно слаборазвитый, может нести артроспоры. (3) Актинопланы (Actinoplanes) – на воздушных гифах образуются спорангии («мешки») с зооспорами либо неподвижными спорангиоспорами (аналоги кокков); надсубстратная часть мицелия образует плотную, почти светонепроницаемую массу.

Физиология: хемоорганогетеротрофия, окисление неорганических соединений серы, утилизация неорганических соединений азота как единственного источника азота.

Отношение к кислороду: аэробы (метаболизм дыхательного типа), либо осуществляют брожение, реже строгие анаэробы.

Отношение к температуре: мезофилы, умеренные термофилы, редко термофилы.

Особенности генома: среди других эубактерий выделяются усложненной организацией генома.

Места обитания: почва, пищеварительный тракт теплокровных, горячие источники.

17. Отдел Нитроспиры – Nitrospira (Nitrospirae).

Включает 3 рода (Leptospirillum, Nitrospira, Thermodesulfovibrio), относящихся к 1 классу.

Филогенетическое положение: древняя филогенетическая линия, которая на филогенетических деревьях, построенных разными способами, занимает непостоянное положение.

Окраска по Граму: грамотрицательные.

Морфология клетки: клетки вибриоидной или спиральной формы. Род Leptospirillum – клетки подвижные, очень мелкие (до 1 мкм длиной). Род Nitrospira отличается очень широким периплазматическим пространством (в 2 раза шире, чем у других грамотрицательных бактерий); клетки неподвижны.

Физиология: несмотря на малое таксономическое разнообразие внутри отдела, разнообразие метаболических путей для представителей велико. Большинство – хемолитоавтотрофы (нитрификаторы, сульфатредукторы). Leptospirillum: источник энергии – ОВ реакции с использованием ионов Fe2+ (в особенности используют сульфид железа); окисляют сульфиды по формуле FeS + O2 -> FeSO4. Nitrospira: источник энергии – ОВ реакции с использованием нитрита железа; для роста необходима морская вода; способны к переключению типов питания ‒ миксотрофии; осуществляет окисление нитритов в нитраты (нитрификацию): NO2 - + 1.5O2 -> NO3 -.

Отношение к кислороду: большинство ‒ аэробы. Thermodesulfovibrio ‒ анаэробы.

Отношение к температуре: термофилы (Thermodesulfovibrio).

Прочие морфофизиологические особенности: имеются виды-магнетотактики – содержащие в клетках магнитные кристаллы, позволяющие выстраиваться клеткам по силовым линиям геомагнитного поля либо двигаться в магнитном поле.

Местообитания: Leptospirillum ‒ ацидофилы, в основном встречаются в месторождениях сульфидных руд; Thermodesulfovibrio ‒ облигатные ацидофилы.